要取得战争的胜利，必须有一支精良的军队。因此，军队的组织和建设，是孙子军事思想的又一个重要的组成部分。
它包括以下内容。
（一）将帅的品质
将帅是军队的组织者、统领者和指挥者。将帅品质的好坏对军队战斗力的强弱至关重要。尤其到春秋中后期，各诸侯国的文武官职逐渐分开，出现了"将军"的职位和称号①。将军长期固定带兵作战，于是，对将帅品质的要求，就成为军事学要解决的热门课题。
孙武认为，将帅必须具备五种品质。他说"将者，智、信、仁、勇、严也。"（《计篇》）这五种品质："智"就是足智多谋，善于在复杂的情况下定出胜敌的妙计。用孙子的话说。就是要"通九变之利"（《九变篇》）；"动而不迷，举而不穷"（《地形篇》）；"能因敌变化而取胜"（《虚实篇》）。"信"就是赏罚有信，言必信，行必果，在士兵中享有威信。这样就能做到"令素行"（《行军篇》）。"仁"就是仁爱部下，也即孙子说的"视卒如婴儿"，"视卒如爱子"（《地形篇》）。"勇"就是骁勇善战，敢打敢拼。"严"就是号令严明，要求军队有严格的纪律。孙武在吴王面前"小试勒兵"时，斩了玩忽军令的吴王的两个爱姬，就是"严"的具体表现。
必须指出，孙武认为将帅必须具备的这五种品质，是辩证统一相辅相成的。汉代王符曾对孙子提出的将帅应具备的这些品质解释道"智以折敌，仁以附众，??信以必赏，勇以益气，严以一令。故折敌则能合变，附众则思力战，??赏罚必则士尽力，气勇益则兵威令自倍，威令一则惟将所使。"（《潜夫论·劝将》）这里闸述五种品质间的辩证关系足比较清楚的。孙武并针对将帅中的一些偏激的弊病议论说"将有五危：必死，可杀也；必生，可虏也；忿速，可侮也；廉洁，可辱也；爱民，可烦也。凡此五者，将之过也，用兵之灾也。"（《九变篇》）对于土卒，"厚而不能使，爱而不能令，乱而不能治，譬若骄子，不可用也。"（《地形篇》）。显然，那些蛮干死拼（"必死"）、容易冲动（"忿速"）、勇而无谋的将帅，那些"爱民"如子、"厚"抚士卒、仁而不严的将帅，那些只顾保全性命（"必生"）、只图"廉洁"名声而不能全面考虑战事的将帅，他们必然会在战争中造成过失，导致"覆军杀将"的灾难。
由于将帅的无能或过失而造成战争失败的事，在春秋时代就可以举出很多。公元前632 年晋楚城濮之战，楚帅子玉向楚王陈述请战的理由是"非敢必有功也，愿以间执（犹塞）谗慝之口。"这明显是为了泄私愤，报复曾讲他过失的人。当楚使者宛春被晋拘留，与国曹、卫受骗而告绝于楚时，子玉更加怒不可遏，急于出击。接着，晋军"曳① 如《国语·晋语四》记："郑人以詹伯为将军"；《谷梁传文公六年》云： "（晋）使狐夜姑为将军"：《公羊传·宣公十二年》称："（楚）将军子重谏"； 《左传·昭公二十八年》载阎没、女宽对魏献子曰："岂将军食之而有不 足？"《史记·司马穰苴传》记：景公"以（司马穰苴）为将军"；《史记·孙子 传》载：吴王阖庐"以（孙武）为将"。等等。
柴而伪遁"，子玉不知是计，随后跟踪追击，结果被晋军"横击"、"夹攻"（《左传·僖公二十八年》），连遭惨败。子玉还是一个粗暴残忍的人，据说他练兵一天，就"鞭七人，（以箭）贯三人耳"（《左传·僖公二十七年》）。正因为楚帅子玉临战无"智"，心地狭窄，"忿速"易怒，又不能"仁"爱部下，与士兵离心离德，故楚军在这次战争中的失败是必然的。再如公元前597 年晋楚之战，晋中军元帅荀林父治军无方，内部意见不统一；其佐彘子擅自出击，他也不能制止；两军对峙，形势紧迫，又不设备；当楚军发起总攻击时，他竟鼓励渡河撤退，下令军中曰："先济者有赏！"以致"中军、下军争舟，舟中之指可掬"（《左传·宣公十二年》）。这次晋军的失败，也是由于主帅缺乏应有的品质所致。由此可见，孙武在当时提出将帅必须具备"智信仁勇严"这五种品质，是有着十分深刻的意义的。
（二） 军队的训练
要建设一支战斗力强的军队，除了选择呼的将帅外，让必须在平时时士卒进行严格的训练。孙武在谈论战争双方胜负的条件时，其中之一就是："士卒孰练？"（《计篇》）他强调："夫金鼓、旌旗者，所以一民之耳目也。民既专一，则勇者不得独进，怯者不得独退，此用众之法也。"（《军争篇》）军队在金鼓旌旗的指挥下，进退整齐，步调一致，这是古代的战争特别应该注意的。孙武认为，要做到这样，必须使"（贵贱少）长远近习此教也，以为恒命。此素教也，将之道也。"（银雀山汉墓竹简《孙子兵法·见吴王》）。所谓"素教"、"恒命"，就是要在平素加强教育、操练，使士兵养成服从命令听指挥的习惯。关于军队如何训练的问题，孙于还指出："凡治众如治寡，分数是也；斗众如斗寡，形名是也。"（《势篇》）刘寅《孙武子直解》谓："偏裨卒伍之分，十百千万之数，各有统制。"曹操注："旌旗曰形，金鼓曰名"；杜牧注"夫形者，陈形也"：王晰注："名者，各有其名号也。"孙武在这里申述，指挥众多的军队参加战斗，像指挥寡少的军队一样，必须依靠组织编制（"分数"）的严密，利用旌旗金鼓、队形名号（"形名"）
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