巴斯德的发现拯救了法国的葡萄酒业和制醋业，并且改良了啤酒酿造工艺。刚解决了酒变酸的问题，亟待解决的蚕病问题又摆在了他的面前。1865年法国南部的一个养蚕中心蔓延着一种奇怪的蚕病，病蚕一批批地相继死去，蚕农们束手无策，整个养蚕业濒于毁灭的境地。巴斯德受农业部委托，通过5年的辛勤工作，终于找到了使蚕患病的细菌，并且有效地防治了蚕病，挽救了处于危机中的法国养蚕业。
除此之外，巴斯德还研究了鸡的霍乱病并成功的研制出防止它的方法。在此基础上还研制出了炭疽病减毒活性疫苗，从而使畜牧业免受灭顶之灾，他的这些成就可以和琴纳使用牛痘对人的天花病产生的免疫能力相媲美。
晚年，他对狂犬病疫苗的研究成为了他事业的光辉的顶点，当时的狂犬病虽不是很常见，但它的死亡率却是100%。为了研制出治疗的方法，巴斯德经常冒着生命危险从患病动物的体内提取病毒，收集疯狗的唾液，他的这种为科学而把生死置之度外的精神使我们对其肃然起敬。功夫不负有心人，他终于找到了治疗狂犬病的方法，制成了原始的巴斯德狂犬病疫苗，并成功地治疗了一位被疯狗咬伤14处的法国小男孩，成为了世界上第一个能挽救狂犬病患者的人。
在这巨大成功的背后，巴斯德所付出的艰辛劳动是难以形容的。特别是在巴斯德全力以赴地研究蚕病并取得很大进展的时候，个人生活中却接连遭到沉重的打击。1865年，慈爱的父亲逝世，一年后爱女夭折，儿子在战争中饱受苦难，另外还受一些人的造谣诽谤。但他仍拼命工作，每天工作达18小时。1868年10月，巴斯德因突发脑溢血而留下半身不遂的后遗症。但他病危时仍念念不忘研究工作，病情稍有好转，又立即恢复工作。
1895年9月25日巴斯德去世。他以五十余年科学研究生涯中坚持不懈地努力，实践着自己的追求和愿望，用自己的行为和精神，塑造了法国人民心中的一座丰碑，被誉为法国“最伟大的民族英雄”。
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