2006年6月，“企业”号航母战斗群代表大西洋舰队，和其他2个航母战斗群，与空军和海军陆战队一同参加在关岛附近举行的大规模联合军事演习。同年7月18日，“企业”号抵达韩国釜山港，对韩国进行为期4天的访问。
2007年，美军为加速向信息化海战的转型而推出的最新一代多功能新概念航母被正式命名为“福特”号。一时之间，已经服役45年的第一代核动力航母“企业”号行将退役的传闻流传甚广。但在次年4月，美国诺斯罗普 格鲁曼公司（简称诺 格公司）与政府订立了一份价值4.533亿美元的合同，对“企业”号航母进行为期16个月的入坞延长可用性维修。
2009年，由于“企业”号未能如期完成维修和改装，媒体再度盛传美国海军将让“企业”号提前退役。实际上只是由于工程量较大，延期了7个月而已。
在经过为期近两年的维护及改造之后，“企业”号终于驶出船坞，再次驰骋大洋。2010年4月12日，在系泊巡航演习中，“企业”号进行了模拟航行补给训练，模拟了海上燃料和干货补给。4月17日，“企业”号起航开始最新的海上测试，在19日返回诺福克海军基地的途中，按照美国海军的传统，“企业”号在桅杆上悬挂起扫把，这意味着全面胜利和海试成功。诺格公司的“企业”号项目负责人戴维 朗称：“对于我们来说，‘企业’号意义非凡，它是美国首艘核动力航空母舰，此次维修将是它生涯中的精彩一页，在造船工人、该舰海军官兵的通力合作下，这艘有着48年舰龄的巨舰才得以重返海军，继续在全球执行重要任务。”
目前，美国海军主力航母是“尼米兹”级航母，其中的最新1艘（也是最后1艘）“乔治 h w 布什”号已经加入现役，而新一代航母“福特”级正在建造。“企业”号在美国海军中，已经是名副其实的老爷舰，但其战斗力仍不可小觑。由于“福特”级航母计划进展不顺，电磁弹射试验遭受了重大失败，在这种背景下，“企业”号重新投入现役，至少能保住美国核动力航母集群的应用规模。
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