哥本哈根物理研究所所长身份和巨大的科研成就，使玻尔在物理界建立了崇高威望，吸引着世界各地的物理学家。时隔不久，一个由国内外杰出的物理学家组成的研究团队——哥本哈根学派形成了。他们在玻尔的领导下，逐渐形成了一种勇猛进取、乐观向上、团结合作、无拘无束的治学风气，在这样的环境影响下，量子力学的基础理论、原子辐射、化学键等重大研究成果像雨后春笋一样相继问世，哥本哈根也一跃成为当时全世界最重要、最活跃的学术中心，而且至今仍有很高的国际地位。
20世纪30年代中后期，当迈特纳和弗里施根据哈恩等人的实验提出了重核裂变的想法时，以玻尔为代表的哥本哈根学派立即展开研究。时隔不久，就提出了原子核的液滴模型，成功地解释了由中子诱发的重核裂变反应，并断言由慢中子引起裂变的是铀-235。这方面的研究将导致了核能的大规模释放，为原子弹的研究奠定了理论基础。
1943年，玻尔从德军占领下的丹麦逃到美国，和许多科学家共同研制了世界上第一颗原子弹。二战结束后，深感核武器危害的玻尔很快回国，在继续主持研究所的工作的同时，也加入了反对战争的行列，大力倡导核能的和平利用。
玻尔一生得到的荣誉，学术头衔，会员资格以及爵位比任何一位同时代的科学家都要多。他对原子科学的贡献也无疑使他站在了爱因斯坦的旁边，成为20世纪中期最伟大的物理学家之一。1962年11月18日，因心脏病突发，玻尔在丹麦哥本哈根的卡尔斯堡寓所离开人世，但他伟大的科学贡献和永恒的“哥本哈根精神”，将永远闪耀着光芒。
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