还有人研究发现，也许耳内寄生虫是使鲸鱼搁浅的罪魁祸首，它们破坏鲸鱼的回声定位系统，误导了鲸鱼而酿成大祸。对死去的鲸鱼解剖发现，死鲸气腮两面红肿病变，原因很可能是定位系统病变，使它们丧失了定向定位能力。
美国生物学教授们认为鲸鱼集体自杀是由于水下爆炸、军舰发动机和声呐的噪音引起的。他们发现1989年10月，24头剑吻鲸冲上加那利群岛沿岸的浅滩，当时该群岛附近海域正在进行军事演习。1985年，军事演习时有12头鲸鱼冲上海滩。1986年4头鲸鱼冲进兰萨罗特岛搁浅，岛屿海域正在进行海军演习。委内瑞拉沿岸发现大批搁浅鲸鱼时，刚好附近也在进行水下爆炸。
法国海洋哺乳类动物研究中心的科列德博士也同意这种说法，他发现军舰声呐和回声探测仪所发出的声波及水下爆炸的噪音，会使鲸鱼的回声定位系统发生紊乱，这是导致鲸鱼集体冲上海滩自杀的主要原因。
到底什么原因导致鲸鱼集体自杀，至今没有定论。
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