华佗的医术非常精湛，《后汉书?华佗传》说他“晓养性之术”、“精于方药”，诊断精确，在内科、外科、妇科、儿科的治疗上都很有心得。他在医学上最重要的贡献是在外科中首创了全身麻醉法，这一特殊的贡献让他成为了中国的“外科鼻祖”。
《后汉书?华佗传》载：“若疾发结于内，针药所不能及者，乃令先以酒服麻沸散，既醉无所觉，因刳破腹背，抽割积聚。”可见有了麻醉散之后，很多因针灸、汤药、药熨疗法无法根治的病都可以迎刃而解了，同时还减轻了病人的痛苦，可惜的是麻醉散的配方现在已经不可考了。其实麻醉性药物很久之前就存在了，但只是人们为达到不可告人的目的而采取的一种手段，并没有用在医学上。麻醉散在外科手术上的使用不仅在我国医学史上，就是在世界医学史上都具有跨时代的意义，而且这个发现比欧洲早了近千年。
华佗还注意到运动对人体疾病的预防作用，于是身体力行发明了“五禽戏”。所谓的“五禽戏”是指：模仿五种动物的动作，再配以合理的气息调理，达到舒筋活血、疏肝健脾、手足关节灵活为目的的一种健身方法，常常练习可以益寿延年。据说，华佗的弟子们由于练习“五禽戏”年近七旬还耳聪目明、齿发坚固。
除此之外，华佗还擅长望诊和切诊，在方药、针术和灸法上也很有造诣，他能通过望诊准确判断出病情，而且只扎几个穴道就可使病人痊愈。
为了使自己的医学经验造福更多的人，华佗一面广收门徒，一面积极撰写书稿，然而他的很多著作都已遗失。幸运的是，他的医道得以流传，而且他的门徒中出现了很多卓有成就的人：樊阿、吴普、李当之，他的一些医学经验也由弟子们继承下来并写进了自己的著作，如李当之的《本草经》。
华佗去世之后，人们为了纪念他多处修建庙宇和墓碑。在他家乡建立的华祖庙中，人们用一副对联来评价他的一生：“医者刳腹，实别开岐圣门庭，谁知狱吏庸才，致使遗书归一炬；士贵洁身，岂屑侍奸雄左右，独憾史臣曲笔，反将厌事谤千秋。”此外后人还用“华佗再世”、“元化重生”来称誉为人们解除病痛的医生，可见华佗对后世影响之深远。
【建安三神医】“建安三神医”是指东汉末年在医学上很有成就的三位医学家：华佗、张仲景、董奉。其中张仲景以《伤寒杂病论》著称于世，并被后人誉为“医圣”。董奉是一位隐士，他医术精湛，医德高尚，行医无论贫富同等对待，而且亲自上山采药，看病不收费用，唯一的要求是病人痊愈之后要在他家屋后种杏树，留下了脍炙人口的杏林佳话。
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